Una de las áreas de conservación es La Reserva Marina de Galápagos (RMG), es también un ecosistema único debido a la confluencia de distintas corrientes marinas de aguas calidas y frías.
Los leones marinos endémicos de Galápagos es una de las especies más comúnmente apreciadas, sin embargo en un corta sumergida se pueden apreciar más de cerca especies nativas y endémicas como los tiburones, las rayas, los peces loro, corales, pepinos de mar y una incontable cantidad de colores tamaño y diferentes diseños de vida marina.
Uno de los mayores y más recientes daños para las especies marinas nativas y endémicas es la pesca industrial, Debido a lo grande que es la RMG, la pesca ha sido difícil de controlar, en especial los la pesca de las aletas de tiburón y pepinos de mar, ambos muy apetecidos en los mercado de los países asiáticos, esto ha causado un daño severo en las poblaciones de estas especies.
Debido a la creciente transportación de producto por parte de los humanos, miles de especies introducidas se presentan en la RMG, pueden llegar adheridas a los cascos de los barcos o dentro de los tanque de lastre, este es un nuevo enfoque de investigación, desde que se estableció la RMG en 1998, los científicos de la FCD están muy ocupados tratando de inventariar y monitorear lo más pronto la vida marina del archipiélago.
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